LabDAO Memetakan Masa Depan AI Open-Source Untuk Penemuan Obat

Proyek Folding@home menjadi berita utama selama pandemi COVID-19 karena mengerahkan daya komputasi yang tidak terpakai untuk menjelajahi ruang pencarian pelipatan protein untuk mengatasi virus corona baru. Memberdayakan warga untuk menjadi ilmuwan dengan hak mereka sendiri, prakarsa ini menjalankan simulasi skala besar dari berbagai konfigurasi molekuler protein di seluruh jaringan terdistribusi komputer "terdaftar" di seluruh dunia.

Paradigma terdesentralisasi ini digembar-gemborkan untuk menyatukan orang-orang di sekitar masalah umum dan daya komputasi crowd-sourcing secara efisien, tetapi bagaimana jika daya komputasi dan infrastruktur pemecahan masalah dibalik? Dengan kata lain, bagaimana jika individu dapat menjalankan proyek mereka sendiri dengan memanfaatkan daya komputasi yang terakumulasi dan alat untuk eksperimen biologi untuk boot?

LabDAO mewujudkan mimpi itu dengan Platform PLEX-nya. PLEX adalah alat baris perintah sumber terbuka yang dirancang untuk membuat tidak hanya sumber daya komputasi tetapi juga berbagai alat pembelajaran mesin-biologis (diciptakan suite "BioML" dalam LabDAO) dapat diakses di berbagai latar belakang. Baik bereksperimen dengan docking molekul kecil atau simulasi pelipatan protein sendiri, PLEX memungkinkan pengguna memanfaatkan pustaka alat LabDAO, membagikan hasil, dan memvisualisasikannya dalam waktu kurang dari lima menit.

Serangkaian alat ini dan platform yang memungkinkan penggunaannya dipajang di KTT Blockchain Meets Biology Zuzalu pada awal April, di mana anggota Tim Inti LabDAO Lily Hansen-Gillis mendemonstrasikan dari awal hingga akhir simulasi dinamika molekuler internal sebuah protein untuk menemukan konfigurasi yang paling stabil. Kemudian, sebagai "non-coder" yang mengaku dirinya, dia memandu penonton dari awal sampai akhir—semuanya dengan komputer, WiFi, PLEX di baris perintah, dan tidak lebih.

Secara lebih luas, LabDAO adalah platform terdesentralisasi yang mendukung web3 (bagian dari gerakan “DeSci” yang lebih besar) yang berkomitmen untuk menciptakan lingkungan yang lebih produktif untuk penemuan obat bertenaga sumber terbuka. Dengan menyediakan alat dan sumber daya canggih untuk ekosistem yang lebih luas, LabDAO bertujuan menciptakan lingkungan yang tepat untuk kemajuan ilmiah yang transparan dan dapat diakses. Baik dengan menghilangkan kebutuhan peneliti untuk memiliki perangkat keras atau infrastruktur komputasi mereka sendiri atau menerbitkan hasil eksperimen pada buku besar blockchain sedemikian rupa sehingga dapat dilacak dan direproduksi, organisasi berkomitmen untuk membuat lebih banyak inovasi melalui kolaborasi — meruntuhkan hambatan yang disebabkan oleh orang miskin. kegunaan dan silo, keahlian khusus.

Upaya LabDAO untuk membangun dunia DeSci masa depan untuk hari ini baru-baru ini menerima dorongan dalam bentuk pendanaan sebesar $3.6 juta dari berbagai DAO lain, Inflection.xyz, Balaji Srinivasan, dan lainnya. Masuknya dukungan ini akan berkontribusi pada upaya berkelanjutan untuk membangun alat perangkat lunak sumber terbuka dan memperkuat ekosistem penelitian LabDAO.

Sedangkan untuk PLEX sendiri, langkah selanjutnya segera termasuk menguji platform dalam berbagai kolaborasi ilmiah, mengemas berbagai alat, dan mengumpulkan perangkat keras yang diperlukan untuk mendorong jaringan BioML.

Adapun untuk jangka panjang, mungkin obat penyelamat hidup berikutnya selama wabah penyakit menular besar berikutnya akan dirancang dengan kekuatan PLEX, satu langkah maju yang terdesentralisasi pada satu waktu. Saat ekosistem terus tumbuh, hanya waktu yang akan menjawabnya.

Terima kasih kepada Aishani Aatresh untuk penelitian dan pelaporan tambahan pada artikel ini. Saya adalah pendiri SynBioBeta, dan beberapa perusahaan yang saya tulis adalah sponsor dari Konferensi SynBioBeta. Untuk lebih banyak konten, Anda dapat berlangganan buletin mingguan saya.